Tem uma área de drenagem de 19.829,46 km², correspondente a 13,37% do território Cearense, sendo o Rio Banabuiú, o principal tributário do Rio Jaguaribe. São seus afluentes pela margem esquerda, os Rios Patu, Quixeramobim e Sitiá e pela margem direita apenas o riacho Livramento. Na Bacia do Banabuiú estão inseridos os seguintes municípios: Banabuiú, Boa Viagem, Ibicuitinga, Itatira, Madalena, Mombaça, Monsenhor Tabosa, Morada Nova, Pedras Brancas, Piquet Carneiro, Quixadá, Quixeramobim, Senador Pompeu, Milhã e Jaguaretama. Esta bacia apresenta uma capacidade de acumulação de águas superficiais de 2.687.840.000 bilhões de m³, num total de 19 açudes públicos gerenciados pela COGERH – Gerência Regional de Quixeramobim, como pode ser visto na tabela abaixo:
| Açude | Município | Capacidade |
| Banabuiú | Banabuiú | 1.600.999.936 |
| Pedra Branca | Quixadá | 434.040.000 |
| Cedro | Quixadá | 126.000.000 |
| Curral Velho | Morada Nova | 12.160.000 |
| Fogareiro | Quixeramobim | 118.820.000 |
| Cipoada | Morada Nova | 83.090.000 |
| Pirabibu | Quixeramobim | 74.000.000 |
| Patu | Senador Pompeu | 71.829.000 |
| Poço do Barro | Morada Nova | 54.700.000 |
| Quixeramobim | Quixeramobim | 54.000.000 |
| Serafim Dias | Mombaça | 43.000.000 |
| Umari | Madalena | 35.040.000 |
| São José II | Piquet Carneiro | 29.140.000 |
| Vieirão | Boa Viagem | 20.960.000 |
| Trapiá | Pedra Branca | 18.190.000 |
| Monsenhor Tabosa | Monsenhor Tabosa | 12.100.000 |
| São José I | Boa Viagem | 7.670.000 |
| Capitão Mor | Pedra Branca | 6.310.000 |
| Jatobá | Milhã | 590.000 |
| Total | 2.687.840.000 |